Digite CMD no menu Executar. Vai abrir a janela do prompt de comando. POr padrão ela é Toda preta com as letras brancas.
Quando ela estiver aberta, clique no icone do lado esquerdo dela e escolha Propriedades.
Na opção Cores, escolha as cores que deseja para o fundo e para o texto.
Clique em OK. Clique em Salvar as propriedades para janelas futuras com o mesmo título.
Pronto.
Você também pode alterar o tamanho padrão da janela e a fonte, seguindo o mesmo processo.